El pene es el órgano copulatorio masculino y está compuesto por raíz, cuerpo y glande (Fig. 8-19). La crura del pene está formada por dos cuerpos cavernosos y el bulbo, que es la expansión caudal del cuerpo esponjoso, constituye la raíz del pene. La crura del pene se fija en el arco isquiático y está cubierta por el m. isquiocavernoso, mientras que el bulbo del pene está cubierto por el m. bulbospongiosum (Fig. 8-19). El cuerpo del pene se encuentra entre la raíz y el glande. En el ratón, el cuerpo del pene tiene una flexión que hace que en estado de no erección el glande del pene se dirija caudalmente. Durante la erección la dirección del glande se invierte (Fig. 8-19). El cuerpo del pene está compuesto por un único cuerpo cavernoso y el cuerpo esponjoso, que rodea la uretra. El cuerpo cavernoso tiene dos surcos, un surco dorsal, que contiene los vasos sanguíneos del pene, y un surco ventral, donde se encuentra el cuerpo esponjoso (Fig. 8-20). Tanto el cuerpo cavernoso como el cuerpo esponjoso están formados por cavidades vasculares rodeadas de tejido conectivo (Figs. 8-20 y 8-26). La disposición tridimensional de las fibras de colágeno en las trabéculas del cuerpo cavernoso varía en función de la zona examinada y se observa fácilmente utilizando luz polarizada (Fig. 8-20).