Chronisk infektion med Helicobacter pylori (H. pylori) er en kendt risikofaktor for mavekræft. Udryddelsesgraden af H. pylori-infektion ved den klassiske trippelbehandling med PPI’er og antibiotika er lav. Derfor er probiotika et nyttigt redskab til at forbedre udryddelsesgraden og reducere bivirkningerne. Flere undersøgelser i dyremodeller viste, at Lactobacillus spp. alene og i kombination med andre probiotiske stammer har en hæmmende virkning på vækst og undertrykkelse af inflammatoriske reaktioner ved H. pylori-infektioner. Nogle undersøgelser viste imidlertid signifikante virkninger af Pediococcus-stammer på undertrykkelse, overlevelse og udryddelse af H. pylori-infektioner. Det foreslås derfor, at man til behandling af H. pylori-infektioner sammen med de sædvanlige probiotiske stammer kan anvende forskellige Pediococcus-stammer. Nylige undersøgelser viste, at Lactobacillus reuteri og Lactobacillus gasseri alene sammen med PPI’er hos mennesker har en høj udryddelseseffekt på H. pylori-infektioner, og det foreslås som probiotisk behandling af patienter i fremtidige terapeutiske protokoller. I forbindelse med den probiotiske behandlingsproces bør det ikke anbefales, at probiotika kan anvendes som en enkeltstående behandling til udryddelse af H. pylori. Anvendelse af probiotika som et supplement vil dog øge udryddelsen og reducere bivirkningerne i forbindelse med behandlingen. Det er en udbredt opfattelse, at probiotika kan forbedre udryddelsen af H. pylori og reducere bivirkningerne under standardbehandling, men nogle probiotiske bakteriearter kan være nyttige sammen med lægemiddelbehandling. Generelt kunne probiotiske kosttilskud øge udryddelsesgraden af H. pylori-infektioner og reducere bivirkningerne af antibiotika.