Opdeling af det mongolske imperium
Slagsmål udspillede sig mellem Kublais hære og hans bror Ariq Bökes hære, der omfattede styrker, som stadig var loyale over for Möngkes tidligere administration. Kublais hær udryddede let Ariq Bokkes tilhængere og overtog kontrollen over den civile administration i det sydlige Mongoliet. Yderligere udfordringer fandt sted fra deres fætre, Chagataiderne. Kublai sendte Abishka, en Chagataid-prins, der var loyal over for ham, for at overtage ledelsen af Chagataids rige. Ariqboke tog imidlertid Abishka til fange og henrettede ham derefter og lod i stedet sin egen mand Alghu krones der. Kublais nye administration blokerede Ariqboke i Mongoliet for at afskære fødevareleverancerne, hvilket forårsagede en hungersnød. Karakorum faldt hurtigt til Kublai, men Ariqboke samledes og genindtog hovedstaden i 1261.
I det sydvestlige Ilkhanat var Hulagu loyal over for sin bror Kublai, men sammenstød med deres fætter Berke, herskeren over Den Gyldne Horde i den nordvestlige del af riget, begyndte i 1262. De mistænkelige dødsfald blandt jochidiske prinser i Hulagus tjeneste, den ulige fordeling af krigsbytte og Hulagus massakrer på muslimer øgede vreden hos Berke, som overvejede at støtte et oprør af det georgiske kongerige mod Hulagus styre i 1259-1260. Berke dannede også en alliance med de egyptiske mamlukker mod Hulagu og støttede Kublais rivaliserende kravmand, Ariqboke.
Hulagu døde den 8. februar 1264. Berke forsøgte at drage fordel heraf og invadere Hulagus rige, men han døde undervejs, og et par måneder senere døde også Alghu Khan af Chagatai-khanatet. Kublai udnævnte Hulagus søn Abaqa som ny ilkhan, og Abaqa søgte udenlandske alliancer, f.eks. forsøgte han at danne en fransk-mongolsk alliance med europæerne mod de egyptiske mamlukker. Kublai udpegede Batus barnebarn Möngke Temür til at lede Den Gyldne Horde. Ariqboqe overgav sig til Kublai i Shangdu den 21. august 1264.
Opsplitning i fire khanaterRediger
Etableringen af Yuan-dynastiet (1271-1368) i Kina af Kublai Khan fremskyndede opsplitningen af det mongolske imperium. Det mongolske imperium splittede sig op i fire khanater. To af disse, Yuan-dynastiet og Ilkhanatet, blev regeret af linjen af Tolui. Den Gyldne Horde blev grundlagt af Jochi-slægten, mens Chagatai-khanatet blev grundlagt af Chagatai. I 1304 etablerede en fredstraktat mellem khanaterne Yuan-dynastiets nominelle overherredømme over de vestlige khanater ved en fredstraktat mellem khanaterne. Dette overherredømme var imidlertid ikke baseret på noget, der lignede de samme grundlag som de tidligere khagans. Konflikter som f.eks. grænsestridigheder mellem dem fortsatte. Et eksempel er krigen mellem Esen Buqa og Ayurbarwada, der fandt sted i 1310’erne. De fire khanater fortsatte med at fungere som separate stater og faldt på forskellige tidspunkter.
Yuan-dynastietRediger
Kublai Khans flytning af hovedstaden i det mongolske imperium til Khanbaliq (Dadu, det nuværende Beijing) i 1264 blev modsat af mange mongoler. Ariq Bökes kamp gik således ud på at bevare rigets centrum i det traditionelle mongolske hjemland. Efter Ariq Bökes død blev kampen videreført af Kaidu, en barnebarn af Ogedei Khan og herre Nayan.
Da Kublai Khan eliminerede Song-dynastiet, fuldendte han erobringen af Kina. Yuan-dynastiets flåder forsøgte at invadere Japan i 1274 og 1281, men begge invasioner mislykkedes, og et stort antal af deres skibe blev ødelagt i havstorme kaldet kamikazes (guddommelige vinde) ved begge lejligheder. Det almindelige folk oplevede hårde oplevelser under Yuan-dynastiet. Derfor gjorde mongolske krigere oprør mod Kublai i 1289. Kublai Khan døde i 1294 og blev efterfulgt af Temür Khan, som fortsatte kampen mod Kaidu, som varede indtil Kaidus død i 1301. Ayurbarwada Buyantu Khan kom til magten i 1312. Civil service eksamenssystemet blev indført for Yuan-dynastiet i 1313.
Et oprør kaldet Red Turban Rebellion begyndte i Kina i 1350’erne, og Yuan-dynastiet blev styrtet af Ming-dynastiet i 1368. Den sidste Yuan-kejseren, Toghon Temür, flygtede nordpå til Yingchang og døde der i 1370. Yuan-resterne, som havde trukket sig tilbage til den mongolske steppe, er kendt som det nordlige Yuan-dynasti og fortsatte med at gøre modstand mod Ming-dynastiet, indtil det blev erobret af det jurchen-ledede Later Jin-dynasti (forgænger for Qing-dynastiet) i 1635.
Gyldne HordeRediger
Den Gyldne Horde blev grundlagt af Batu, søn af Jochi, i 1243. Den Gyldne Horde omfattede Volga-regionen, Uralbjergene, stepperne ved det nordlige Sortehav, det forreste Kaukasus, det vestlige Sibirien, Aralsøen og Irtysh-bassinet og havde fyrstendømmer af Rus i tributforhold.
Hovedstaden var oprindeligt Sarai Batu og senere Sarai Berke. Dette omfattende imperium svækkedes under rivalisering mellem Batus efterkommere og splittedes i løbet af det 15. århundrede i khanatet Kazan, Astrakhan-khanatet, Krim-khanatet, Sibirien-khanatet, Store Horde, Nogai-horden og Hvide Horde. En forenet Rus erobrede khanatet Kazan i 1552, Astrakhan-khanatet i 1556, Sibirien-khanatet i 1582, og det russiske imperium erobrede Krim-khanatet i 1783.
Chagatai-khanatetRediger
Chagatai-khanatet delte sig i 1266 og dækkede Centralasien, Balkhasj-søen, Kashgarien, Afghanistan og Zhetysu. Det var delt mellem det bosatte Transoxanien (Ma Wara’un-Nahr) i vest og det nomadiske Moghulistan i øst. Det hævdes, at dele af dem stadig talte mongolsk indtil slutningen af det 16. århundrede.
Moghulistan blev stærkere under Timur (1395-1405), en krigsherre fra Barlas-klanen, der herskede. Timur besejrede Tokhtamysh Khan af Den Gyldne Horde i 1395 og fratog ham Fore-Caucasus. Han ødelagde den osmanniske sultans hær nær Ankara, hvilket forsinkede en osmannisk erobring af Det Byzantinske Rige i et halvt århundrede. Det timuridiske imperium splittedes kort efter hans død.
Timur’s barnebarn Ulugh Beg (1409-1449) regerede Transoxanien, og under hans styre opnåede handel og økonomi i Transoxanien en betydelig udvikling. Ulugh Beg byggede et astronomisk observatorium nær Samarkand i 1429 og skrev sit værk Zij-i-Sultani, der omfatter astronomiske teorier og et katalog over 1000 stjerner med deres præcise positioner på himmelsfæren.
En lang rivalisering mellem Moghulistan og Oiraterne om handelsruterne endte med Moghulistan’s nederlag til Oiraterne i 1530. Babur, en timuridisk hersker fra Kabul, erobrede det meste af Indien i 1526 og grundlagde mogulriget. Mogulriget splittedes op i flere mindre stater i det 18. og 19. århundrede, og senere blev hovedstaden i det tidligere imperium erobret af det britiske imperium i 1858.
IlkhanatRediger
Ilkhanatet, der blev regeret af det toluidiske hus Hulagu, blev dannet i 1256 og omfattede Iran, Irak, Transkaukasus, det østlige Lilleasien og det vestlige Turkestan. Mens de tidlige herskere i khanatet i stigende grad antog tibetansk buddhisme, konverterede de mongolske herskere til islam efter tronbestigelsen af Ilkhan Ghazan (1295-1304). I 1300 begyndte Rashid-al-Din Hamadani i samarbejde med mongolske historikere at skrive Jami al-Tawarikh (Sudur un Chigulgan, Kompendium af krøniker) på Ghazans ordre. Værket blev afsluttet i 1311 under Ilkhan Öljeitü (1304-1316). Altan Debter, skrevet af en mongolsk historiker Bolad Chinsan, tjente som grundlag for at skrive Jami al-Tawarikh. Efter Abu Sa’id’s død (1316-1335) opløstes Ilkhanatet hurtigt i flere stater. Den mest fremtrædende var Jalayrid-dynastiet, der blev regeret af efterkommere af Mukhali af Jalair.