Det limbiske system (det emotionelle motoriske system) er ansvarligt for oplevelsen og udtrykket af følelser. Det er placeret i hjernens kerne og omfatter amygdala, hippocampus og hypothalamus.
I hjernens limbiske system omsættes oplevelsen til udtryk. Amygdalaen i det limbiske system behandler input fra alle dine sansesystemer – syn, berøring, hørelse, smag og lugt. Lugtesystemet er koblet direkte ind i det limbiske system. Følelsesmæssige oplevelser formidles af tovejsforbindelser mellem amygdalaen og frontallapperne (den tænkende hjerne). Dit rige indre følelsesliv afhænger af denne indbyrdes sammenhæng. Amygdala er porten til det limbiske system og videregiver sensoriske input til hypothalamus.
Hypothalamus er kontrolcenteret for det limbiske system og er forbundet med hypofysen og det autonome nervesystem. Det er ansvarligt for det kropslige udtryk for følelsesmæssige reaktioner, som f.eks. frygt og vrede. Disse følelsesmæssige reaktioner på opfattet trussel er som computerprogrammer, der fungerer i dit forsvar, og som hjælper dig med at imødegå fare og trussel. Neurovidenskabsmand Joseph LeDoux skriver, at følelser er biologiske funktioner i centralnervesystemet (CNS), der er fast installeret, og som har udviklet sig for at hjælpe dyr med at overleve i et fjendtligt miljø. Stimulering af dette følelsesmotoriske system påvirker alle kroppens organer gennem kommunikationssystemerne mellem sind, krop og ånd. Dette forklarer, hvordan synet af en truende tiger kan øge din hjerterytme og dit blodtryk, få dig til at svede, stramme dine muskler og trække din tarm sammen. Det er sådan, at kropslige symptomer er relateret til følelsesmæssige sindstilstande.