Achromobacter- og Alcaligenes-arter

De taksonomiske betegnelser for Achromobacter- og Alcaligenes-arter har været særligt forvirrende. Achromobacter xylosoxidans blev omdøbt til Alcaligenes xylosoxidans subsp. xylosoxydans, men 16S rRNA-sekvensanalyse og undersøgelser af guanin-cytosinindholdet støtter en placering af denne organisme tilbage i Achromobacter-slægten.88 Andre Alcaligenes-arter, A. ruhlandii, A. piechaudii og A. denitrificans, er også blevet overført til Achromobacter. Organismer, der tidligere blev betragtet som Achromobacter-grupperne A, C og D (og før det CDC-grupperne Vd-1 og Vd-2), benævnes nu Ochrobactrum anthropi og betragtes separat. Achromobacter-arter er ikke-fermenterende gramnegative bakterier, der findes i jord og vand, herunder svømmebassiner, brøndvand, dialyseløsninger og klorhexidinopløsninger. De kan lejlighedsvis genfindes i luftvejene og mave-tarmkanalen, primært hos personer, der er i kontakt med sundhedsvæsenet. Infektion opstår, når de indføres i sår eller koloniserer personer med svækket værtsforsvar. Klinisk relevante arter omfatter de asaccharolytiske arter A. dentrificans, A. piechaudii og Alcaligenes faecalis (denne organisme tilhører fortsat slægten Alcaligenes), den saccharolytiske art A. xylosoxidans og den unavngivne Achromobacter-gruppe F. Selv om Achromobacter gruppe B (nu klassificeret sammen med Achromobacter gruppe E som Pannonibacter phragmitetus) undertiden betragtes som en kontaminant, er den blevet genfundet fra blodet fra patienter med klinisk sepsis og endokarditis.89

A. xylosoxidans er den mest klinisk vigtige af disse organismer. Den er sandsynligvis en del af den endogene mikrobiota i øret og mave-tarmkanalen og er en almindelig kontaminant i væsker.90 Organismen har været involveret i udbrud af nosokomial infektion i forbindelse med kontaminerede opløsninger (f.eks. intravenøse væsker, hæmodialysevæske, skyllevæske, mundskyllevæske), tryktransducere, inkubatorer og befugtere samt kontaminerede sæbe- og desinfektionsmidler.91 Forurening af brøndvand var infektionskilden i et tilfælde af bakteriæmi.92 Klinisk sygdom, der er forårsaget af A. xylosoxidans, har involveret isolater fra blod, peritoneal- og pleuravæske, urin, respiratoriske sekreter og sårekssudater. Bakteriæmi, der ofte er relateret til intravaskulære katetre, er den hyppigst rapporterede infektion og er ofte polymikrobiel hos patienter med underliggende maligniteter93,94 . Der er rapporteret om galdevejssepsis, meningitis (undertiden med lymfocytær prædominans i cerebrospinalvæske), pneumoni (nosokomial og samfundserhvervet), peritonitis (herunder spontan bakteriel peritonitis og peritonitis hos patienter i kontinuerlig ambulant peritonealdialyse), urinvejsinfektion, konjunktivitis, osteomyelitis, proteseknæinfektion, mesh-infektion, inficeret nekrotiserende pancreatitis og proteseklapendokarditis.90,91-99 Patienterne har ofte en immunsupprimeret tilstand som f.eks. kræft eller HIV-infektion, men dette er ikke altid tilfældet, især ikke i nosokomiale udbrud.94,98 A. xylosoxidans samt andre Achromobacter-arter er blevet genvundet med stigende hyppighed fra respiratoriske sekretioner fra personer med cystisk fibrose.99 Kolonisering har været forbundet med forværring af respiratoriske symptomer, muligvis som følge af en forværring af det inflammatoriske respons forårsaget af lipopolysaccharid (LPS) og en cytotoksisk faktor produceret af Achromobacter.99,100 Flere case-kontrolundersøgelser har ikke vist en hurtigere forværring af den kliniske status eller lungefunktionsstatus blandt cystisk fibrosepatienter, der kronisk er koloniseret med Achromobacter- eller Alcaligenes-arter, undtagen i en undergruppe af patienter med en hurtig stigning i specifikke udfældningsantistoffer mod A. xylosoxidans.101 Genopretning ved neonatal infektion kan skyldes perinatal overførsel fra moderen.102

A. denitrificans er blevet genfundet som enkeltpatogen fra blod, cerebrospinalvæske og andre normalt sterile kropsvæsker samt fra en nyreabsces og i blandet kultur fra steder, der normalt indeholder normal mikrobiota.103 Kun få nyere publikationer har behandlet den patogene rolle af disse organismer. A. piechaudii blev antaget at forårsage kronisk otitis hos en diabetisk patient104 og er også blevet genfundet fra blod hos en patient med en hæmatologisk malignitet og et inficeret Hickman-kateter, som havde tilbagevendende bakteriæmi.105

Alcaligenes faecalis kan genfindes i en række forskellige kliniske omgivelser. De fleste isolater af A. faecalis fra blod eller respiratoriske sekretioner er relateret til kontaminering af hospitalsudstyr eller væsker med organismen, med deraf følgende kolonisering eller infektion hos mennesker. Urinen er det andet almindelige genfindingssted, selv om den sjældent forårsager symptomatisk urinvejsinfektion. Den er også blevet genvundet fra hornhindesår, øreudladninger, sårdrænage, peritonealvæske og afføring.106-108 Den genvindes sjældent i renkultur fra nogen af disse steder.

Fylogenetisk og biokemisk er Alcaligenes og Achromobacter nært beslægtet med slægten Bordetella. Achromobacter-arter vokser godt på standardmikrobiologiske medier, herunder MacConkey agar. De danner flade, spredte og ru kolonier og har peritrichous flagella, hvilket er kendetegn, der hjælper dem med at adskille dem fra pseudomonader. Størstedelen af stammerne vokser også på Burkholderia cepacia selektiv agar. Organismerne er oxidase- og katalasepositive og oxiderer glukose og producerer syre, men er urease- og indol-negative. A. xylosoxidans oxiderer, som artsnavnet antyder, let xylose, hvilket adskiller den fra andre arter i slægten. Det er vanskeligt at skelne organismerne fra hinanden og bekræfte identifikationen, fordi de ikke er reaktive i mange biokemiske eller assimileringstest. MALDI-TOF-massespektrometri giver nøjagtig identifikation af denne gruppe organismer og vil spille en stigende rolle, efterhånden som teknologien bliver mere udbredt.

Et isolat af A. xylosoxidans kan let forveksles med en ikke-P. aeruginosa-stamme af Pseudomonas eller med en stamme af B. cepacia-komplekset, men det usædvanlige modtagelighedsmønster tyder på den korrekte identitet. A. faecalis producerer en karakteristisk sødlig lugt, der ligner den af grønne æbler. Piperacillin-tazobactam og carbapenemer er aktive in vitro og vil være en passende indledende behandling af alvorlige A. xylosoxidans-infektioner, mens trimethoprim-sulfamethoxazol kan anvendes til urinvejsinfektioner og andre infektioner, der ikke kræver parenteral behandling. Ceftazidim har også aktivitet, selv om stammerne generelt er resistente over for andre cefalosporiner, penicilliner med smalt spektrum, aztreonam og aminoglykosider. Modtageligheden over for fluoroquinoloner er varierende. Høje koncentrationer af colistin hæmmer de fleste stammer. Der er konstateret høj resistens over for ciprofloxacin og aminoglykosider i stammer isoleret fra cystisk fibrosepatienter. Resistensmekanismer omfatter en konstitutiv oxacillinase og erhvervede β-lactamaser samt multidrug effluxpumper.109 Tilstedeværelsen af IMP-, VIM- eller TMB-type metallo-β-lactamase gener båret på overførbare klasse 1 integroner kan producere carbapenemresistens og har potentiale for horisontal overførsel.110,111

A. faecalis-stammer er normalt modtagelige for trimethoprim-sulfamethoxazol, ureidopenicilliner, carbapenemer og, i modsætning til Achromobacter-arter, de fleste cefalosporiner.107 Resultaterne varierer for aztreonam, fluorokinoloner og aminoglykosider, og resistens over for gentamicin er almindelig.107 Produktion af β-lactamase med udvidet spektrum er også blevet beskrevet hos A. faecalis.