Bonner ist Co-Autor von Financial Reckoning Day: Surviving The Soft Depression of The 21st Century und Empire of Debt mit Addison Wiggin. Außerdem ist er zusammen mit Lila Rajiva Autor von Mobs, Messiahs and Markets. Die letztgenannte Publikation wurde 2008 mit dem GetAbstract International Book Award ausgezeichnet. Zuvor hat er zusammen mit dem britischen Medienhistoriker John Campbell und dem ehemaligen Herausgeber der Times, Lord William Rees-Mogg, zwei kurze Pamphlete verfasst und zusammen mit dem Intellektuellenhistoriker Pierre Lemieux einen Essayband herausgegeben.

In seinen beiden Finanzbüchern sowie in The Daily Reckoning vertritt Bonner die Ansicht, dass die finanzielle Zukunft der Vereinigten Staaten aufgrund verschiedener wirtschaftlicher und demografischer Trends gefährdet ist, zu denen nicht zuletzt das große Handelsdefizit der USA gehört. Er behauptet, dass Amerikas außenpolitische Heldentaten der Errichtung eines Imperiums gleichkommen und dass die Kosten für die Aufrechterhaltung eines solchen Imperiums Amerikas endgültigen Niedergang beschleunigen könnten. Bonner argumentiert in seinem neuesten Buch, dass Mob- und Massenwahn Teil der conditio humana sind.

Bonner warnte 2015, dass das Kreditsystem, das seit den 1950er Jahren die wesentliche Grundlage der US-Wirtschaft ist, unweigerlich zusammenbrechen und zu einem katastrophalen Zusammenbruch des Bankensystems führen wird.